test: 完善多份测试用例的类型标注与校验逻辑

1. 为多个测试函数补充pytest.CaptureFixture[str]类型注解
2. 为graphlib类型声明文件补全方法参数类型
3. 为pdftool测试的mock函数添加Any类型标注
4. 新增数据库连接非空校验断言
5. 优化emlmanager测试的字典展开格式与修复decode测试bug
6. 为gittool测试添加命令类型列表校验
7. 为envrs测试添加pyrefly忽略注释

tests/test_task_edge_cases.py

@@ -177,7 +177,7 @@ def test_taskspec_shell_cmd_file_not_found_mocked():
         _ = wrapped_fn()
 
 
-def test_taskspec_shell_cmd_with_cwd_verbose(capsys):
+def test_taskspec_shell_cmd_with_cwd_verbose(capsys: pytest.CaptureFixture[str]):
     """Test TaskSpec._wrap_cmd with shell command, cwd and verbose=True."""
     with tempfile.TemporaryDirectory() as tmpdir:
         if sys.platform == "win32":